JR東日本は、20日に続いて21日の大雨の影響による計画運休を発表しました。県内を走るJRの在来線は、20日は雨の影響で各路線で運転見合わせや遅れが発生しました。

21日かけても大雨が見込まれるため、JR東は計画運休を発表しました。
新潟ー酒田駅間、または秋田駅間の「特急いなほ」は、夜にかけて多くの時間帯で全区間運休となります。また、快速海里は新潟駅午前10時11分発と、酒田駅午後3時3分発の往路・復路とも運休です。
また羽越線は、村上ー酒田駅間で遅れや運休が発生する恐れがあるとしています。